细菌污染是为常见的一种污染类型，也是容易分辨和判断的类型。细胞被细菌污染后，培养基会变得浑浊、发黄，在显微镜下观察细菌形态通常呈球状或杆状，分布也比较均匀，有定向运动；增殖速度极快，并伴随有大量酸性物质产生，受细菌污染的细胞镜下观察发现其胞质中会出现大量颗粒物，并且细胞的生长速度缓慢，形态逐渐变圆直至死亡，如若不及时处理，细胞基本会全军覆没。

注：在细胞生长良好的情况下如不及时更换培养基，培养基中的营养物质被细胞逐渐消耗，培养基颜色也会逐渐变黄，所以还要注意观察细胞的生长状况，不是所有的培养基变黄都是由细菌污染造成的。

常见的真菌污染主要包括念珠菌、酵母菌和霉菌污染。真菌污染时，培养基无明显颜色变化，但会有肉眼可见的菌落形成。显微镜下可观察到丝状、管状、树枝状或链球状的菌丝。其中，霉菌污染比较好辨别，培养基中通常会出现絮状物，而其他大部分真菌污染后培养基仍然是清亮的。

支原体污染在细胞培养中发生率较高的污染类型，比细菌、真菌污染更加难以察觉，培养基不浑浊，细胞形态变化不显著。由于支原体是目前已知的小的原核生物，所以在显微镜下无法观察到。细胞受支原体污染后，培养基无明显变化，但细胞的生长速度会明显减慢，细胞状态明显受到影响，会产生很多细小的碎片，细胞的形态也会发生变化，细胞间会出现“拉丝”现象。

黑胶虫污染是比较好辨别的。通常情况下，细胞受黑胶虫污染后经过显微镜观察会发现镜下在细胞周围和培养基中会出现大量“小黑点”，且在不停运动，且随着培养时间的延长，“小黑点”逐渐增多，更换培养液和PBS洗涤也无法将其清除。受黑胶虫污染后，培养基染色一般不会发生改变，但细胞生长缓慢，有时甚至出现空泡，细胞状态明显变差。

细胞间交叉污染情况通常出现在同时培养处理几种细胞。由于使用器具和培养基混杂，或者操作失误引起的。为避免此种污染，可以一次处理一种细胞；不可避免要同时处理多种细胞时，应做好标记，移液管和枪头不应接触瓶口；同时细胞早期应做好充足的冻存储备，以备不时之需。

1.实验前后均需对实验环境进行清洁，除用消毒试剂进行擦拭外，还需用紫外灯进行照射；

2.尽量避免将外界环境中的微生物带入实验室，因此在进入实验室之前，换用干净的实验服、鞋套、口罩、帽子。

3.提前准备好细胞实验操作所用到的所有的实验试剂及耗材，用酒精棉球擦拭物品表面后再将其放入超净工作台或生物安全柜中进行紫外灯照射；

4.细胞实验所用到的实验试剂和耗材好严格密封，尽量避免长期暴露在空气中，且在生物安全柜或超净工作台中进行拆封；

5.取放细胞时，不仅要对培养瓶表面进行消毒，还需对手部、培养箱外表面进行消毒，且每次手在进出时必须消毒；

6.大部分实验室没有独立的细胞房，多个课题组混用同一个细胞房。因此，在取放细胞时，还需要注意培养箱中其他细胞的培养状态，如有异常，及时转移细胞，以免受到污染。