产品简介:
超灵敏/超稳定的荧光核酸染料,实验表明在凝胶染色浓度下无致突变性,通过荧光共振能量转移FRET的独特设计改善了同类产品对大片段DNA条带拖尾模糊的现象,带形清晰整齐,迁移率好,定量准确,染色均匀,灵敏度高,稳定性高,Safe Red是一种油性大分子(分子量>1000)。
产品特点:
1. 带形清晰整齐:该核酸染料完全克服了原装国外同类产品对大片段DNA条带弥散的缺点,电泳条带清晰整齐美观。
2. 安全无毒:独特油性大分子使其不能穿透细胞膜进入细胞,Ames-test实验表明,该染料没有EB的致癌性诱变性。
3. 迁移率好:EB小分子很快跑出胶外,所以EB容易导致小DNA片段看不清,我们的大分子SafeRed完全克服这一点。
4. 定量准确:适用于核酸分子大小的确定和定量,EB对小DNA片段定量不准确。
5. 染色均匀:电泳时染色均匀,靠近负极凝胶和靠近正极端的亮度一样。EB会导致胶的整体背景稍微高些,经常出现阴阳背景(胶的背景一部分亮一部分暗);长时间、长距离的电泳,EB信号强度会相应下降。我们的大分子SafeRed完全克服这一点。
6. 灵敏度高:适用于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移率与EB相同,小于SYBRGreenI。
7. 稳定性高:耐热,可加在缓冲液里,100℃溶解凝胶,防止染色剂没充分混匀。适用于使用微波或其它加热方法制备琼脂糖凝胶;室温下在酸或碱缓冲液中极其稳定。
8. 耐光性强:实验室的日常光线下在棕色冻存管中可以常温放置24个月。
9. 信噪比好:样品荧光信号强,背景信号低,荧光亮度是EB的十倍以上,肉眼可观测到亮度明显比EB强,EB会导致胶的整体背景稍高些,经常出现阴阳背景。
10. 操作简单:与EB用法完全一样,在预制胶和电泳过程中染料不降解;而电泳后染色过程也只需30分钟且无需脱色或冲洗,即可直接用紫外凝胶透射仪观察。
11. 适用范围广:可选择电泳前染色(胶染法)或电泳后染色(泡染法);适用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳;可用于dsDNA、ssDNA或RNA染色。
12. 完美兼容:与EB有相同的光谱特性,无需改变滤光片及观察装置:标准的EB滤光片或SYBR滤光片都适用,使用与观察EB相同的普通紫外凝胶透射仪观察即可,在300nm紫外光附近可得到最佳激发。
操作步骤:
一.胶染法(推荐方法,用法类似EB)制胶时加入SafeRed核酸染料(染料灵敏,每100mL琼脂糖溶液中加入10ul SafeRed原装液即可)。按常规方法电泳。
1. 实验室材料和试剂:
(1)实验试剂:质粒DNA,DNAmarker,1XTAE电泳缓冲液,1XTBE电泳缓冲液,溴酚蓝指示剂,1%的琼脂糖凝胶。
(2)实验仪器:电泳仪(130v),移液器(0.5~10ul),凝胶成像仪。
2.实验步骤:
(1)制胶:将0.5g琼脂糖溶于50mL 1X TAE电泳缓冲液中,加热至琼脂糖完全融化。将融好的琼脂糖溶液室温放置50℃左右加入5ul的SafeRed凝胶电泳染料,摇匀。
(2)倒胶:将制好的琼脂糖凝胶缓慢倒于制胶托盘内,避免产生气泡。将点样梳子垂直置于电泳胶膜的一端,距离托盘底部约1mm。放置时尽量保持平稳,切勿晃动。
(3)置胶:待约30分钟左右胶体充分凝固后,缓慢垂直向上拔起点样梳子,切勿用力过猛。(夏季适当延长凝胶时间)
(4)将琼脂糖凝胶放入电泳槽内,加入电泳缓冲液,使电泳缓冲液液面高于凝胶面约1~2mm。
(5)将混合溴酚蓝指示剂的DNA样本(1ul溴酚蓝与5ulDNA标本混合)加入到点样孔内。
(6)盖上电泳槽盖,开启电源,使DNA从负极移向正极恒压电泳(电压恒定在120~130v之间,一般可选择130V)。
(7)当DNA条带距离点样孔约1~2cm后关闭电源,(约30~40分钟)取出凝胶。
(8)用302nm激发的UV凝胶成像系统观察结果。
注意事项:
1. 此方法染色染料用量相对较少。染料加入胶中可直接使用微波炉加热,制好的胶溶液可以在室温下保存直至用完。
2. 尽管多数国产的DNAmarker浓度较高,经测试我们的SafeRed仍然适用,不需要像国外同类产品稀释Marker一倍后使用!
3. 更换电泳缓冲液,新配置的电泳液效果好!TBE缓冲液比TAE效果好,因为含硼酸盐的试剂导电性能更好。
4. 电泳时电压不宜过高,一般不要超过130V。
5. 对DNA的迁移率和条带分离效果SafeRed与EB相比,完全一样!但是EB会导致胶的整体背景稍微高些,经常出现阴阳背景(胶的背景一部分亮一部分暗),这个方法可以区分染料是否是EB配置的。
6. SafeRed染料和样品混合后,点样到琼脂糖凝胶中,不推荐这种点样法。
7. 由于SafeRed具有良好的热稳定性,可以在热的琼脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷却。摇晃,振荡或者翻转以保证染料充分混匀。也可以选择将SafeRed储液加到琼脂糖粉末和电泳缓冲液中,然后用微波炉或其他常用方式加热以制备琼脂糖凝胶。SafeRed兼容所有常用的电泳缓冲溶液。
8. 如果总是看到条带弥散或分离不理想,为了避免染料可能对DNA迁移的干扰,建议使用电泳后染胶。使用泡染法染色以确认问题是否与染料有关。如果染色后问题依旧存在,则说明问题与染料无关!如果不立刻测量吸光度,可在每个孔中加入10ul 1%w/vSDS或0.1MHCl,盖好并在室温下避光保存。24小时内不会观察到吸光度变化。
二.泡染法
(1)按照常规方法进行电泳。用于胶回收等高浓度DNA样品强烈推荐泡染法!
(2)用H2O将 SafeRed 10,000×储液稀释约3,300倍到0.1MNaCl溶液中,制成3×染色液。
(3)将凝胶小心地放入合适的容器中,如聚丙烯容器中。缓慢加入足量的3×染色液浸没凝胶。室温振荡染色30min左右,最佳染色时间根据凝胶厚度以及琼脂糖浓度不同而略有不同。对于含3.5~10%丙烯酰胺的凝胶,染色时间通常介于30min到1h,并随丙烯酰胺含量增加而延长。
(4)用302nm激发的UV凝胶成像系统观察结果。
注意事项:
用泡染法染色时,染料用量较多。单次使用的染色液可重复使用3次左右;3×SafeRed染色液可以大量制备,在室温下避光保存直至用完。